คลอโรฟิลล์ทุกตัวจะจับอยู่กับโปรตีนเกิดเป็นสารสีโมเลกุลใหญ่เก็บเกี่ยวแสง (light harvesting complex) โมเลกุลใหญ่นี้ทำหน้าที่เป็นตัวรวบรวมแสงส่งและผ่านเป็นทอด ๆ ไปยังศูนย์เกิดปฏิกิริยา กล่าวคือทำหน้าที่คล้าย ๆ กับกรวยรับแสง เพื่อรวบรวมพลังงานของแสงไปยังศูนย์เกิดปฏิกิริยา ( หรืออาจเปรียบได้เหมือนจานรับสัญญานโทรทัศน์ )   ซึ่งโมเลกุลของคลอโรฟิลล์ที่ทำหน้าที่เก็บเกี่ยวแสง (สีเขียวอ่อนในรูปที่ 1)  ดังกล่าวนี้จะทำหน้าที่ส่งผ่านพลังงานของโฟตอน ( หน่วยของแสง ) จากโมเลกุลหนึ่งไปยังอีกโมเลกุลหนึ่งอย่างไม่เป็นระเบียบ (random)  จนกระทั่งไปถึงคลอโรฟิลล์กับโปรตีนที่เป็นศูนย์เกิดปฏิกิริยา (สีเขียวเข้มในรูปที่ 1)  บางส่วนของพลังงานนี้ ( ส่วนน้อย ) จะสูญเสียไปในรูปของแสงฟลูออเรสเซนต์

รูปที่ 1  การส่งต่อของพลังงานของแสง (โฟตอน) ผ่านสารสี (คลอโรฟิลล์) เก็บเกี่ยวแสง

โครงสร้างจากการศึกษาทาง  X - ray  ของสารสีเก็บเกี่ยวแสง (light harvesting complex) ได้แสดงไว้ในรูปที่ 2   จะเห็นโมเลกุลของคลอโรฟฟิลล์ (สีเขียว) แทรกอยู่ระหว่างสายโปลีเป็ปไทด์ (สีฟ้าและม่วง)   ในสารสีเก็บเกี่ยวแสงของพืชสีเขียวส่วนใหญ่มักจะมีสารสีชนิดอื่นอยู่ด้วยกัน  เช่น  แคโรทีนอยด์ที่เห็นเป็นสีเหลืองในรูปที่ 2

รูปที่  2  โครงสร้างจากการศึกษาทาง  X - ray  ของสารสีเก็บเกี่ยวแสง