ดังนั้น สหพันธ์ชีวเคมีนานาชาติ หรือ The International Union of Biochemistry (IUB) จึงได้กำหนดให้มีการจัดระบบการเรียกชื่อเอนไซม์ใหม่ เพื่อความสะดวกในการนำไปใช้งาน และความเป็นระเบียบ โดยใช้เป็นรหัสเอนไซม์ หรือ Enzyme Commission number (EC) ในการนี้ได้แยกเอนไซม์ ออกเป็น 6 กลุ่ม และแบ่งย่อยเป็นคลาสย่อยตามปฏิกิริยาที่เกิดขึ้น

     EC number นี้จะเป็นตัวเลข 4 ตัวของระบบเลขรหัส โดยเลขตัวที่ 1 แสดง คลาส (class) ที่เอนไซม์นั้นๆ ได้ถูกจัดไว้ ตัวเลขที่ 2 และ3 แสดงคลาสย่อย (sub class และ sub-sub class) ซึ่งจะบอกถึงชนิดของปฏิกิริยาที่ถูกเร่ง และ ตัวเลขที่ 4 แสดง serial number (หมายเลขที่กำหนดให้) จะช่วยแยกเอนไซม์ที่เร่งปฏิกิริยา คล้ายกันออกจากกัน